O pantoprazol pode alterar a absorção de medicamentos cuja biodisponibilidade seja dependente do pH do suco gástrico, como por exemplo, o cetoconazol. Isso se aplica, também, aos medicamentos ingeridos pouco tempo antes de pantoprazol. O pantoprazol é extensivamente metabolizado no fígado¹. Inicialmente sofre demetilação e oxidação a sulfonas pelas subenzimas CYP2C19 e CYP3A4 do citocromo P450 (fase I do metabolismo²). Como conseqüência da baixa afinidade pelas enzimas do citocromo P450 de pantoprazol e de seus metabólitos³, o hidroxipantoprazol e hidroxipantoprazol sulfona, seu potencial de interação na fase I é limitado, o que permite que a droga saia rapidamente do retículo endoplasmático e seja subseqüentemente transferida para o citoplasma⁴ para ser conjugada com sulfato, na fase II do metabolismo². Esta baixa afinidade resulta em predominância do metabolismo² no sistema de conjugação (fase II) que, ao contrário do sistema P450, não é saturável e conseqüentemente nãointerativa. Etapa esta independente do sistema enzimático citocromo P450. A interação entre o pantoprazol e outras substâncias metabolizadas pela fase I do metabolismo² não pode, em princípio, ser excluído. Nos estudos sobre interações medicamentosas, existentes até o momento, onde foram analisados os substratos de todas as famílias do citocromo P450 envolvidas no metabolismo² de drogas no homem, verificou-se que pantoprazol não afeta a farmacocinética ou a farmacodinâmica de antipirina, carbamazepina, cafeína, diazepam, diclofenaco, digoxina, etanol, glibenclamida, metoprolol, nifedipino, femprocumona, fenitoína, teofilina, varfarina e contraceptivos orais. A ingestão de antiácidos⁵ não interfere na absorção do pantoprazol. O pantoprazol não aumenta a excreção urinária dos marcadores de indução, ácido D-glucarídico e 6 ß-hidroxicortisol. Da mesma forma, as drogas investigadas não influenciaram a farmacocinética do pantoprazol. Estudos de interação farmacocinética em humanos, administrando-se pantoprazol simultaneamente aos antibióticos claritromicina, metronidazol e amoxicilina, não demonstraram nenhuma interação clinicamente significativa.